А на счёт пульта, то может есть какой-нибудь Irlink для Linux, он же как-то с помощью Java работает?
В "родном" софте этого тюнера используется прога которая "следит" за пультом. Устанавливал FlyTv 2000 и FlyDS там в самой программе управление пультом предусматривается. Кстати, эти проги лучше, чем родные. Под must die я пользовался FlyTv 2000.