Ссылку смотрел. Я не настолько разбираюсь в Linux. Все равно не слишком понятно. sudo это ограниченный root,su это то root,su - это как если бы root.
Более того, переменная $HOME будет указывать на каталог пользователя, и все программы, запущенные в режиме суперпользователя, сохранят свои настройки с правами рута в каталоге пользователя, что в дальнейшем может вызвать проблемы.
Вот и проблема с корзиной. Зачем так сделано? Вроде нигде больше такого не встречал.
Я просто привык работать с sudo,просто и понятно.