Он в кедах будет работать?
тут есть нюанс. В "кедах", то есть, с использованием соответствующих библиотек и настроек, очевидно, нет. Но как приложение с окошками, конечно, запустится. С библиотеками Gnome, которые вытянет при установке. Интерфейс окна будет гномий, внешне будет нарушать общий вид дизайна десктопа, но и только. А работать - будет.
Старый манагер сносить надо? Если да, то как?
может быть, и не надо. Вообще, если они вместе не живут, мантейнеры, в теории, должны были выставить конфликты в пакетах.