У всех компьютеров в сетке (и на Линуксе, и на Винде) получают адрес DNS-сервера вместе с IP.
Правильней говорить "получают от DHCP сервера".
Так вот, я думаю, что где-то в настройках DNS прописано при запросе "сервер 1" перенаправлять на "сервер 2". Вот только не могу найти где...
Это заблуждение. DNS сервер не занимается пере направлением трафика вообще. По этому прописать в нем пере направления просто не где. Ведь вы именно об пере направлении трафика говорите? Этим занимается пакетный фильтр.
Первое, что вам нужно выяснить, какие IP отдает DNS для серверов.
HOSTS (не уверен в написании)
PING (самый простой способ)
А самое правильное с помощью DIG, или в ручную просмотреть файл зоны, если нет DDNS.
Уже после этого нужно думать, куда рыть дальше. А еще лучше будет, если вы правильно сформулируете вопрос, или опишите ситуацию, опустив все "я думаю".
Да, и еще одна подсказочка. Сопоставлением IP и имен занимается минимум три службы. Нужно быть точно уверенным, что используется именно DNS для разрешения имен в локальной сети.