а потом с винды через Easy BCD прописывать их загрузку.
Зачем? В BIOS или UEFI выставьте диск, на котором установлен linux, в качестве загрузочного. Загрузитесь в linux, в терминале дайте команду от root'a
grub-mkconfig -o /boot/grub/grub.cfg
GRUB найдет все установленные на дисках загрузчики (в том числе и виндовские) и пропишет их в своё меню.