В общем-то удачность обновления зависит от мантейнера пакета - именно он отвечает за работу пакета. Если в багзиле нет багов , то при ошибке мантейнера её могут просто не заметить, именно поэтому важно вносить такие баги в багзилу. А человек, вносящий пакет в репозиторий физически не может проверить все пакеты, обновляемые в репозитории. Нет баги - нет проблемы. нет исправления её, вплоть до того, что о ней мантейнер может и не знать (обычно у него куча пакетов, форум он не отслеживает, хорошо, если в рассылке появляется),
Как я понимаю, резко изменилась структура пакетов, связанных с Apache, и поэтому должны были или сохраниться старые конфиги, а новые переименовались в имя_конфига.rpmnew, или старые переимнованы в имя_конфига.save.