Все же оказалось дистрозависимое. В ALT Linux OpenVPN chroot-ится в /var/lib/openvpn, но при этом папка ccd изначально не имеется и линка на нее из чрута нет. Создал папку ccd внутри чрута - и все пошло.
Мое личное мнение, не претендующее на истину в последней инстанции -это все же баг, если из-за чрута ломается конфигурирование.