Было у меня такое с трекером. Думал просто отключить, но решил сначала разобраться. Начал выяснять, понял что проблемы - со скоростью работы жесткого диска. Дальше обнаружил, что создавая разделы, не учел размеры сектора (4КБ) и разбивал диск по старинке, границами на 512 байт. Об этом ясно сказала гномовская Дисковая утилита (palimpsest). Пришлось переразбивать жесткий диск. Сейчас вообще не замечаю работу трекера.