Папку с именем vhdl необходимо создать вручную и поместить в скрытую директорию /home/имя_пользователя/.qucs Тогда все моделируется. В помощь книги на русском: QucsUserGuide, Workbook, Qucs и FlowCode, они есть в интернете. Думается, что это промашка разработчика программы (все-таки Qucs еще beta).