Новая версия будет, скорее всего, использовать профиль в домашней папке. Поэтому профиль (home/имя_пользователя/.mozilla) лучше куда-нибудь перенести (или переименовать) до того, как вы запустите бинарник из распакованного каталога. Если же вы его запустили до переноса/переименования профиля, то придётся распаковать папку с браузером из архива заново с предварительным удалением ранее распакованной.