В целом решил, хотя пришлось кое-что править вручную...
И так, выключаем Transmission или останавливаем демон (как в моём случае), удаляем соответствующие файлы в конфиге Transmission в папке resume, запускаем обратно программу или демон. Стоит заметить, Transmission сразу же начнёт качать эти раздачи в папку для загрузок по умолчанию! Имейте это в виду...
[решено]
