Все что в /home - файлы пользователя. Соответственно удалять безопасно с точки зрения системы.
Журнал - либо перенастройте в память по инструкции которую привел Руслан и потом удалите, либо просто уменьшите максимальный размер журнала в настройках (как написано по ссылке которую давал я) и перезагрузитесь. Насколько я понимаю система в этом случае его сама обрежет.