1. Вариант с подводными камнями: apt-get dist-upgrade
Пользователей много? ибо
2. Если до 10 и пароли известны, то, возможно, проще перенести /home (а если он в отдельном разделе, то ещё проще, просто его не форматировать) и заново создать тех же пользователей с теми же именами и паролями. Да, создавать в том же порядке, чтобы не заморачиваться потом на chown
3. Если много, то. Сохранить каталог /etc/tcb, файлы /etc/group, /etc/gshadow, /etc/passwd, /etc/shadow
В файлах оставиь только строки, относящиеся к пользователям, в tcb оставить соответствующие каталоги.
Дописать в новой системе сохранённое к соответствующим файлам (cat oldfile/etc/passwd >> /etc/passwd) и скопировать остатки tcb в /etc/tcb. Восстановить /home как в пункте 2
