Спасибо большое за желание помочь. Я нашла проблему, просмотрела все каталоги, оказалось что еще изменился файл php.ini. Я установила настройки как файле php.ini.save и все заработало. Я вспомнила, что когда настраивала сервер, увеличивала лимит памяти в этом файле, а без этого moodle не работала.
Я советую ВСЕ настройки веб-сервера, которые вы изменяете(к примеру, лимит памяти), записывать себе в блокнотик или куда нибудь. А после каждого обновления проверять, не сбросились настройки в исходное состояние.
