Что-то я не помню, чтобы dd писал "No space left on device" при копировании идентичных HDD... Но, если утверждаете, что всё идентично, тогда, может быть, просто баг у той версии, или я внимания не обращал.
На всякий случай покажите, что fdisk -l /dev/sda показывает сейчас.
Если с sda всё нормально и без путаницы, то да, с /dev/sdb, наверное, надо поступить аналогично. Кстати, тест SMART по нему запускали ? Чем кончилось ?